在哈利波特：魔法觉醒中，寻找线索是推进剧情、探索魔法世界及获取丰厚奖励的核心玩法，线索主要分为拼图寻宝线索与禁林探索线索两大类，你需要理解不同线索的提示指向，并前往游戏内的特定场景进行互动或挑战来获取它们，整个寻找过程需要你细心观察线索描述并与霍格沃茨及对角巷的各个地点建立联系。
拼图寻宝活动会每日提供若干条文字线索，这些线索往往含蓄地指向某个地点或人物，你需要根据提示前往对应位置，例如在图书馆的最右边、在决斗俱乐部门口左边的围墙上面或对角巷裁缝店旁边的建筑，抵达正确地点后点击出现的金色光点即可获得拼图碎片，部分线索如前往那间教室，寻找变形的真谛则明确指引你进入城堡主楼的变形课教室，在讲桌前发现目标，而像不同的植物有不同的用途这类提示，则需要你前往草药学教室，在其左侧区域找到相应药草进行互动。
禁林线索是解锁禁林探索关卡的关键道具，分为蓝色、紫色和红色等不同品质，蓝色线索作为基础线索，主要通过参与每日的决斗俱乐部、课堂、舞会等日常活动随机掉落，每天有获取数量上限，紫色和红色线索则相对稀有，部分可通过完成蓝色线索关卡、特定任务或通关高难度禁林概率获得，获取后你需要在禁林中使用相应线索来开启探索，不同星级的关卡会掉落不同品质的回响等奖励。
部分线索的获取需要满足特定条件或完成前置挑战，例如线索黑魔法？我会让皮皮鬼见识黑魔法的提示你前往黑魔法防御课教室，与皮皮鬼对话并正确回答其问题，随后通过战斗才能获得碎片，更为隐蔽的线索如特殊的口令也许会暴露校长们奇怪的爱好，则要求你先在学分商店购买隐形药水配方并制作，饮用隐形药水后才能进入校长室，在冥想盆与壁炉之间的墙边找到拼图碎片，因此仔细解读线索中的每一个细节是成功的关键。
